I sesong 2 rømmer Clarke og finner ut at det er en stor mengde menneskelige overlevende på planeten, men de har ikke bygd opp motstand mot stråling slik 100 har. I mellomtiden finner kansler Jaha en baby i arken og planlegger å dra til jorden. Imidlertid krasjer han land og blir senere reddet av en gutt som heter Zoran som er på leting etter City of Light sammen med foreldrene.
